課程資訊
課程名稱
結構生物學概論
Introduction to Structural Biology 
開課學期
102-1 
授課對象
生命科學院  生化科技研究所  
授課教師
楊啟伸 
課號
BST5008 
課程識別碼
B22 U0180 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
必修 
上課時間
星期五3,4(10:20~12:10) 
上課地點
農化二B10-1 
備註
A群組必修10學分課程之一。先修科目:生物化學或生物化學概論。
總人數上限:80人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1021bst_sb 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
本課程尚未建立核心能力關連
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程之教學,在於使學生對現代結構生學之內容、重要性和其未來發展,有一較為全面而完整的認識。鑑於在最近的生命科學發展中,約略是以生命生理、結構生物、生命作用動態分析、生物資訊以及生命科技應用為五大發展方向。而就此目前之發展趨勢來說來
分析,其中以結構生物和任何其它四個發展方向結合,無疑地已成為追求更深入之生命知識和科技研究的主要潮流之一。 

課程目標
本課程之目的,在於藉由結合理論、研究方法(包括重要結構生物電腦軟體之學習和使用)和在每一個主題中的多個經典之成功研究成果解釋結構生物學,使生化科技學系學生以及對結構生物學有興趣之他系學生,可以有系統地熟悉結構生物學之實質研究內容和方法,並對結構生物學之優點和貢獻有完整而清晰之認識。 
課程要求
修過生物化學 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
 
參考書目
1. Gregory A. Petsko and Dagmar Ringe (2003). Protein Structure and Function,
4th ed., New Science Press

2. David Whitford (2005). Proteins: Structure and Function, John Wiley & Sons

3. Updated materials from Journal publications. 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
Final exam 
30% 
 
2. 
Computational software application report 
20% 
 
3. 
Group oral presentation 
20% 
 
4. 
Mit-term 
30% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
9/13  Introduction to structural biology 
第2週
9/20  New look at the amino acids in structural biological ways. 
第3週
9/27  The basic blocks of protein structures: Alpha-helix, Beta-sheet, Beta-turns, Beta-bulge, Loops. Available software for PDB file display. 
第4週
10/04  1. Five basic protein structural domains.
2. Protein functions within cells.
3. Protein physiological functions. 
第5週
10/11  1. Protein Functional Domain and Classifications.

2. Motif

3. Protein Conformational Changes
 
第6週
10/18  Introduction to tools for resolving protein structures: An overview. 
第7週
10/25  Tools for resolving protein structure: X-ray diffraction. 
第8週
11/01  Tools for resolving protein structure: CryoEM, NMR and others.
 
第9週
11/08  1. Mid-term exam:
 
第10週
11/15  Structural Biology Study Tools 2:
Tools for resolving protein structure: CryoEM, NMR and others. 
第11週
11/22  Advanced topics in tools for resolving protein structure (1): X-ray diffraction and CryoEM 
第12週
11/29  Advanced topics in tools for resolving protein structure (2): X-ray diffraction and CryoEM 
第13週
12/06  BYOC (Bring your own computer) day: 1. PDB Files Format 2. Software usage. 3. Bioinformatic analysis. 
第14週
12/13  Structural biology and Life science:
1. Cell physiology
2. Membrane proteins (channels, Photoreceptors)
3. G proteins system and associate proteins
4. E. coli chemotaxis system 
第15週
12/20  1. Structural biology and Cell Physiology and Membrane Proteins

2. Group 1 - 4 presentation. 
第16週
12/27  1. Structural Biology for Photoreceptors and G proteins.

2. Group 5 - 8 presentation. 
第17週
1/03/2014  1. Structural Biology and bacterial chemotaxis

2. Group 9 & 10 presentations

3. Close remarks